Бонуси у матч-3 рівнях Fishdom з'являються, якщо зібрати комбінацію із чотирьох і більше фішок. Зараз у грі доступні такі типи бонусів:

Петарда — здійснює вибух радіусом в одну клітинку. Щоб отримати петарду, необхідно зібрати комбінацію із чотирьох фішок одного кольору.

Бомба— здійснює вибух радіусом у дві клітини. Щоб отримати бомбу, необхідно зібрати комбінацію із п'яти фішок одного кольору.

Динаміт — здійснює вибух радіусом у три клітини. Щоб отримати динаміт, необхідно зібрати комбінацію із шести фішок одного кольору.

Боєголовка— здійснює вибух радіусом у чотири клітини. Щоб отримати боєголовку, необхідно зібрати комбінацію із семи фішок одного кольору.

Блискавка— знищує всі фішки одного кольору. Щоб отримати блискавку, потрібно спочатку зарядити її, підриваючи інші бонуси.

Електрошторм— очищає три ряди фішок по горизонталі або по вертикалі. Щоб отримати електрошторм, спочатку необхідно зарядити його, підриваючи інші бонуси.